Información General

Nuestro grupo surgió gracias a nuestros inicios en 2008 donde establecimos una fuerte conexión entre lagunas clínicas (tumor urológico) y biomarcadores moleculares. Nos dimos cuenta de que las estrategias clínicas actuales en tumores como los de próstata o riñón carecían de paneles moleculares robustos. Además, comprendimos la gran heterogeneidad tumoral que existe en estos pacientes y donde las estrategias ómicas podrían proporcionar una respuesta clínica directa. A lo largo de los años, nuestros descubrimientos nos han llevado a comprender el papel de cada marcador molecular en el desarrollo del cáncer y a descifrar las intrincadas redes que remodelan la estructura genética del cáncer en diferentes tejidos y células. También hemos explorado cómo los factores ambientales contribuyen a la formación de tumores, considerando el exposoma y su impacto en los reguladores epigenéticos dentro de esta compleja red metabólica. Centramos nuestras estrategias en la búsqueda de marcadores no invasivos que puedan mejorar la estratificación de pacientes utilizando diferentes metodologías de integración ómica.

Somos un grupo multidisciplinar formado por médicos clínicos, farmacéuticos clínicos, biólogos e informáticos. La mayor parte del grupo está adscrito al Departamento de Bioquímica y Biología Molecular III e Inmunología de la Universidad de Granada, Servicio de Urología y Farmacia Hospitalaria del Hospital Universitario Virgen de las Nieves. Gracias a la actividad multidisciplinar, actualmente contamos con aproximadamente 1.000 muestras de cáncer de próstata (biopsias de tejidos (frescos y FFPE), sangre y/u orina). Además de las muestras biológicas mencionadas, también disponemos de un registro longitudinal de datos personales, clínicos y ambientales.

Además, formamos parte del consorcio internacional de cáncer de próstata (PRACTICAL), lo que facilita la obtención de muestras y las conexiones con todos los grupos internacionales centrados en el estudio del cáncer de próstata. Actualmente, tenemos una fuerte colaboración con la Universidad de St. George’s del Reino Unido como colaboradores activos del equipo de Investigación en Cáncer de Próstata con sede en St. George’s, Universidad de Londres a cargo de Clara Cieza y Ferran Valderrama (Universidad de St. George’s, Londres, Reino Unido), donde actualmente estamos desarrollando experimentos en esferoides y organoides en cáncer de próstata (derivados de pacientes prostáticos de nuestra colección).

¿En qué se centra nuestra línea de investigación?

  • Integración de datos ómicos para la búsqueda de biomarcadores moleculares asociados a cánceres urológicos:

El estudio de tumores urológicos incluye aquellos como el cáncer de próstata o vejiga; pero también, otros menos frecuentes pero más agresivos como el cáncer de riñón. Combinamos las principales técnicas ómicas para la búsqueda de biomarcadores en tumores sólidos (en tejido parafinado y mediante análisis Single Cell en biopsias frescas) y biopsia líquida. Utilizando la secuenciación de nueva generación (NGS), podemos alcanzar una visión completa del panorama genético de cada paciente, desenmascarando biomarcadores que permitan estratificar de forma precoz y precisa a los pacientes en función de su futura agresividad, pronóstico o respuesta al tratamiento. Así, mediante técnicas no invasivas la detección de estos biomarcadores supondrá un cambio en el enfoque del tratamiento hacia una medicina personalizada y de precisión.

  • Papel de las variantes genéticas en las enzimas metabólicas xenobióticas en el cáncer. Interacción gen-ambiente mediante el análisis del exposoma:

La combinación de exposiciones ambientales (exposoma) aporta un nuevo enfoque a la etiología del cáncer. Los efectos sobre la salud de estas exposiciones dependen de factores genéticos como los genes que codifican las enzimas metabolizadoras de xenobióticos (XME) y las enzimas de defensa antioxidante. Sin embargo, las vías metabólicas en las que participan estas enzimas no están bien estudiadas en el cáncer y no se ha establecido una relación clara entre las diferentes isoformas con la agresividad del cáncer. Actualmente, el grupo está centrado en la evaluación de diferentes factores genéticos en tumores urológicos y su asociación con el exposoma mediante la integración de cuestionarios y biomonitorización. Esta combinación puede contribuir a la detección de biomarcadores de exposición útiles para la prevención y el tratamiento personalizados basados en el entorno de cada paciente.

  • Identificación de marcadores genéticos asociados a fármacos utilizados en cáncer y validación funcional

Aproximadamente -15-20 de todas las pacientes tratadas con hormonas dejan de responder al tratamiento y en unos 3 años progresan a resistentes al tratamiento (CPRC). Por ello, nuestro grupo pretende identificar marcadores genéticos que expliquen dicha falta de respuesta a los fármacos (Goserelina, Leuprorelina,Triptorelina, Histrelina, Abiraterona, Enzalutamida, Apalutamida y Darolutamida). Además, desarrollaremos la validación funcional in vitro de las mismas para intentar incluir estas variantes como biomarcadores en la práctica clínica diaria.

Biografía relacionada de la línea de investigación del grupo:

  • Multi-omic study to unmask genes involved in prostate cancer development in a multi-case family. Chica-Redecillas L, Cuenca-Lopez S, Andres-Leon E, Terron-Camero LC, Cano-Gutierrez B, Cozar JM, Lorente JA, Vazquez-Alonso F, Martinez-Gonzalez LJ, Alvarez-Cubero MJ. Cancer Commun (Lond). 2024 Mar;44(3):443-447. doi: 10.1002/cac2.12501.
  • Genetic variants of antioxidant and xenobiotic metabolizing enzymes and their association with prostate cancer: A meta-analysis and functional in silico analysis. Álvarez-González B, Porras-Quesada P, Arenas-Rodríguez V, Tamayo-Gómez A, Vázquez-Alonso F, Martínez-González LJ, Hernández AF, Álvarez-Cubero MJ. Sci Total Environ. 2023 Nov 10;898:165530. doi: 10.1016/j.scitotenv.2023.165530.
  • Explainable artificial intelligence to predict and identify prostate cancer tissue by gene expression. Ramírez-Mena A, Andrés-León E, Alvarez-Cubero MJ, Anguita-Ruiz A, Martinez-Gonzalez LJ, Alcala-Fdez J.Comput Methods Programs Biomed. 2023 Oct;240:107719. doi: 10.1016/j.cmpb.2023.107719.
  • Follow-Up Biomarkers in the Evolution of Prostate Cancer, Levels of S100A4 as a Detector in Plasma. Alvarez-Cubero MJ, Arance E, de Santiago E, Sanchez P, Sepúlveda MR, Marrero R, Lorente JA, Gonzalez-Cabezuelo JM, Cuenca-Lopez S, Cozar JM, Vazquez-Alonso F, Martinez-Gonzalez LJ. Int J Mol Sci. 2022 Dec 29;24(1):547. doi: 10.3390/ijms24010547.
  • Genetic variants of antioxidant enzymes and environmental exposures as molecular biomarkers associated with the risk and aggressiveness of bladder cancer. Martin-Way D, Puche-Sanz I, Cozar JM, Zafra-Gomez A, Gomez-Regalado MDC, Morales-Alvarez CM, Hernandez AF, Martinez-Gonzalez LJ, Alvarez-Cubero MJ. Sci Total Environ. 2022 Oct 15;843:156965. doi: 10.1016/j.scitotenv.2022.156965.
  • A 12-gene pharmacogenetic panel to prevent adverse drug reactions: an open-label, multicentre, controlled, cluster-randomised crossover implementation study. Swen JJ, van der Wouden CH, Manson LE, Abdullah-Koolmees H, Blagec K, Blagus T, Böhringer S, Cambon-Thomsen A, Cecchin E, Cheung KC, Deneer VH, Dupui M, Ingelman-Sundberg M, Jonsson S, Joefield-Roka C, Just KS, Karlsson MO, Konta L, Koopmann R, Kriek M, Lehr T, Mitropoulou C, Rial-Sebbag E, Rollinson V, Roncato R, Samwald M, Schaeffeler E, Skokou M, Schwab M, Steinberger D, Stingl JC, Tremmel R, Turner RM, van Rhenen MH, Dávila Fajardo CL, Dolžan V, Patrinos GP, Pirmohamed M, Sunder-Plassmann G, Toffoli G, Guchelaar HJ; Ubiquitous Pharmacogenomics Consortium. Lancet. 2023 Feb 4;401(10374):347-356. doi: 10.1016/S0140-6736(22)01841-4.
    • Impacto científico y social

    Es conocido el alto impacto social de algunas enfermedades urológicas, principalmente el cáncer de próstata. Disponer de un mejor conocimiento y clasificación ayudaría a mejorar la calidad de vida de estos pacientes. En la actualidad, aún siendo una de las neoplasias malignas más frecuentes entre los hombres, todavía se desconocen marcadores moleculares en su manejo. Por esta razón, la idea básica de nuestro grupo es que el fenotipado masivo ayudará a clasificar los datos obtenidos por el genotipado masivo. Mi equipo está centrado en encontrar marcas moleculares que nos permitan individualizar el tumor en cada uno de sus estadios, y poder optimizar cada señal a detectar en fluidos biológicos para su aplicación en la práctica clínica diaria.

    Alineación con la actividad investigadora actual y futura de GENyO

    La actividad del grupo está en línea con la actividad científica del centro de investigación GENyO, promoviendo una visión multidisciplinar de problemas biomédicos como el cáncer. El enfoque de nuestra investigación posibilita la integración de diversas estrategias, abriendo las puertas a la sinergia entre grupos de Genómica funcional y Medicina Personalizada. Gracias a nuestra activa colaboración con Bionformáticos de la UGR y del CSIC (López Neyra), Grupo de Epidemiología y Salud Pública IBS- (IS-E15) y clínicos, nuestra línea de investigación está produciendo algunos de los datos por doctorados multidisciplinares.

    Miembros
    Proyectos
    Mejora en la selección de tratamiento de pacientes de cáncer de próstata mediante la incorporación de biomarcadores a una herramienta explicable generada con Machine Learning (C-EXP-213-UGR23).
    PCA-MARK - Herramienta de ayuda a la decisión en la selección de tratamiento de pacientes de cáncer de próstata /PMPTA23/00025
    Estrategias para optimizar el tratamiento en pacientes con cáncer de próstata.
    Aplicación de datos moleculares para la identificación de biomarcadores asociados a la resistencia a la castración y otros tratamientos en adyuvancia en el tratamiento de cáncer de próstata (PIP-0043-2022).
    Publicaciones