Genética de enfermedades complejas

Dra. Marta Alarcón

Investigadora Principal

Información general

Áreas científicas de interés

Siguiendo la explosión de hallazgos en genética de los últimos 10 años, ha resultado claro que la contribución de los polimorfismos genéticos al desarrollo de las enfermedades complejas es limitada. Basados en esto, hemos definido formas novedosas de estudiar las enfermedades, en particular las enfermedades autoinmunes sistémicas utilizando la búsqueda de una visión de diagnóstico molecular y no clínico. El diagnóstico clínico tiene sus limitaciones. Este ha sido el objetivo del proyecto PRECISESADS financiado por la agencia de la Iniciative de Medicamentos Innovadores de la Unión Europea. El proyecto tiene por objetivo la estratificación molecular de las enfermedades autoinmunes sistémicas. Basados en esta estratificación molecular se busca ahora los mecanismos de no respuesta al tratamiento y de la remisión de las enfermedades. Este proyecto está siendo financiado por la misma agencia de la UE, el proyecto 3TR, ambos coordinados por la Dra Alarcón-Riquelme. El grupo de investigación está por tanto al frente de la investigación de las enfermedades mediadas por el sistema inmunitario bajo la coordinación de dos proyectos Europeos de gran envergadura. Se describen también otras áreas de investigación.

Líneas de investigación

Estudio de las bases genéticas en el Lupus Eritematoso Sistémico o generalizado (LES):
El lupus eritematoso sistémico (LES) es una enfermedad compleja de etiología desconocida. Se caracteriza por la inflamación y daño tisular mediado por el sistema inmune. Hay evidencia sustancial de la contribución de factores genéticos que combinados con factores ambientales interactúan en el desarrollo de la enfermedad. El lupus tiene un componente genético importante ya que hasta un 8-12% de las mujeres con lupus tienen un familiar con la enfermedad. Nuestro grupo identificó, entre otros, el gen BANK1 con el que hemos estado trabajando varios años y del cual hemos averiguado que interactúa con otras moléculas de la vía de los receptores TOLL, como son MYD88 y TRAF6. Hemos visto que la deficiencia del gen en ratones que desarrollan lupus de forma espontánea, existe una disminución importante en la producción de citoquinas pro-inflamatorias y particularmente de la producción de IgG y autoanticuerpos, una característica de la enfermedad. En este proyecto estamos trabajando para describir nuevos genes de la enfermedad con variantes tanto comunes como raras y en colaboración con investigadores de varios países. También utilizamos la estratificación molecular para definir nuevas asociaciones genéticas de relevancia para las vías detrás del desarrollo de la enfermedad.
Estudio de la Estratificación Molecular de la enfermedad:
Este estudio tiene como objetivo el uso integrado de la transcriptómica y la epigenómica en sangre y en tejidos relevantes o células de importancia en el desarrollo de las enfermedades mediadas por el sistema inmune y específicamente por las enfermedades autoinmunes sistémicas. De esta manera estamos definiendo las vías moleculares de la enfermedad. Esto llevará a nuevos diagnósticos moleculares y a potenciar la medicina personalizada. Puede encontrarse más información en www.precisesads.eu.
Estudio de los mecanismos de no respuesta a tratamiento:
Este es un proyecto nuevo financiado por la Unión Europea (3tr-imi.eu). El proyecto estratificará a pacientes en base a los datos de transcriptómica y epigenómica de sangre y tejidos para la identificación de las dianas mas propicias para el tratamiento y prevenir daño tisular. Un estudio clínico prospectivo junto con estudios clínicos ya iniciados serán analizados para lograr los mejores resultados hacia la compensión de dichos mecanismos. Hasta un 30% de los pacientes tratados no responden a las terapias. Habiendo descartado la falta de adherencia a la medicación recetada o la presencia de anticuerpos anti droga en el caso de los medicamentos biológicos, nuevos mecanismos moleculares serán investigados. Este estudio tuvo su comienzo en septiembre del 2019.

Plataformas tecnológicas

- Equipo NextSeq 500 de nueva generación
- Illumina iScan: Equipo de genotipado de alto rendimiento.
- Equipo de citometría de masas Helios/Fluidigm
- Varios equipos de citometría de flujo, imágen y sorting.
- Microscopía confocal

Agencias financiadoras de los proyectos del grupo

- European Science Foundation financiada por fondos de FMR (Austria), FNRS (Bélgica), FWO (Bélgica), RPF (Chipre), Danish Medical Research Council, DFG (Alemania), FCT (Portugal), CSIC (España, MICINN (España), Swedish Research Council, SNF (Suiza), MRC (Reino Unido). (2009-2014)
- Instituto de Salud Carlos III (FIS, Miguel Servet, Rio Hortega and Sara Borrell programs) (2009-2015)
- Ministerio de Economía y Competitividad, Plan Estatal de fomento de la Investigación Científica de Excelencia 2016 (2017-2020)
- Swedish Research Council (2009-2013 and 2017-2020)
- Fundación Ramón Areces (2011-2015)
- Innovative Medicines Initiative Program of the European Unión (2014-2018): special funding of the project PRECISESADS
- Innovative Medicines Initiative Program of the European Union (2019-2026): special funding of the project 3TR

Información complementaria

Colaboraciones internacionales: La Dra Alarcón-Riquelme lidera la entidad gestora del proyecto PRECISESADS (equivalente a coordinadora científica) del IMI sobre la «Reclasificación Molecular de las Enfermedades Autoinmunes Sistémicas» que reúne a 21 centros académicos europeos, 2 PyMES y 5 grandes farmacéuticas. Ella coordina el proyecto 3TR: Tratamiento, dianas, taxonomía y remisión: Identificación de los mecanismos moleculares de no respuesta a tratamiento, recaídas y remisión en enfermedades autoinmunes, inflamatorias y alérgicas. Este proyecto incluye a 58 grupos académicos, 3 PyMES y 8 grandes farmacéuticas.