Bioinformática y Ciencia de Datos en Salud

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Dr. Pedro Carmona

Investigador Principal

Áreas científicas de interés

El interés de nuestro grupo se centra en el desarrollo de nuevas técnicas computacionales para la integración y análisis de grandes volúmenes de datos biomédicos. En particular, trabajamos en metodologías para el análisis integrado de datos multi-omicos de alta dimensionalidad con el objetivo de lograr una mejor comprensión de los mecanismos moleculares asociados a enfermedades complejas, avanzar en su diagnóstico y tratamiento. En los últimos años nos estamos centrando también en metodologías para la predicción de fenotipos y respuesta a tratamiento a partir de datos transcripcionales de célula única y el desarrollo de técnicas estadísticas avanzadas para el manejo y análisis de historiales clínicos electrónicos. Una parte importante de nuestras líneas de investigación es el desarrollo de aplicaciones software que ponen disponibles las metodologías desarrolladas para su uso por parte de la comunidad científica, así como establecer colaboraciones con grupos experimentales y clínicos que nos permiten abordar problemas complejos desde un abordaje multidisciplinar.

Líneas de investigación

  • Métodos para el análisis integrado de datos multiómicos: Estamos interesados en desarrollar nuevas metodologías capaces de integrar información heterogénea disponible en repositorios públicos. Con las metodologías adecuadas, estos datos son una fuente inestimable para generar nuevo conocimientos, hipótesis y modelos predictivos. En concreto, estamos desarrollando nuevos métodos y software basados en técnicas de meta-análisis para la integración de datos para la fusión de datos ómicos.
  • Desarrollo de técnicas computacionales para establecer firmas moleculares y modelos de predicción de respuesta a fármacos y clasificación de pacientes: Estamos creando algoritmos para establecer firmas moleculares que definan nuevos modelos de clasificación y guíen en la predicción de respuestas a tratamientos o pronóstico de patologías, integrando además información procedente de historias clínicas electrónicas.
  • Desarrollo de software y herramientas de análisis bioinformático: Uno de nuestros objetivos es también desarrollar aplicaciones de código abierto que pongan nuestras metodologías a disposición de la comunidad científica. Estas aplicaciones se utilizan ampliamente para analizar datos biomédicos. La lista de software desarrollado está disponible en https://compbio.ugr.es/tools/.

Agencias financiadoras de los proyectos del grupo

  • EMBO
  • Ministerio de educación, ciencia y universidades.
  • Consejería de salud de la Junta de Andalucía.
  • Consejería de economía, conocimiento, empresas y universidad de la Junta de Andalucía.
  • Universidad de Granada.

Plataformas tecnológicas

    • Plataforma 1 Desarrollo de Software
    • Plataforma 2 Técnicas estadísticas y de machine learning aplicadas a biomedicina
    • Plataforma 3 Análisis de datos omicos (Genómica, Transcriptómica, Epigenómica, …)
    • Plataforma 4 Análisis de datos de single cell
    • Plataforma 5. Bases de datos en Biología

Información complementaria

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Título: Diagnóstico rápido de la telangiectasia hemorrágica hereditaria mediante microRNAs exosomales de plasma sanguíneo
Autores (1er Apellido, Iniciales): Francisco Javier Blanco López; Pedro Carmona Sáez; Luisa María Botella Cubells
Solicitante: Universidad de Granada
Fecha Prioridad: 15/04/2019

Título: Systemic autoimmune diseases diagnostic and/or prognostic method
Autores (1er Apellido, Iniciales): Marta Alarcón Riquelme; Guillermo Barturen Briñas; Daniel Toro Dominguez; Manuel Martinez Bueno; Pedro Carmona Saez; Elena Carnero Montoro
Solicitante: Fundación Progreso y Salud
Fecha Prioridad: 28/06/2019