Listado de Servicios:


1) Asesoramiento científico.

2) Plataformas de microarrays de alto rendimiento. iScan (Illumina) y High Resolution C Scanner (Agilent)

  • Genotipado de SNPs e identificación de CNV.
  • Análisis de expresión de genoma completo.
  • Estudios de metilación y transcripción.
  • Análisis citogenéticos.
  • Estudios de ligamiento.
  • Genotipado de Genoma completo.
  • Análisis de regulación y epigenética.
  • Ver listado completo
3) Secuenciación de nueva generación (SOLID).

  • Genómica:
    • Resecuenciación dirigida (exoma, genes concretos, long-range PCR...)
    • Resecuenciación de genoma completo (genoma humano, ADN mitocondrial, microbiano…)
    • Secuenciación de novo  
  • Expresión:
    • Análisis de expresión génica.
    • Análisis de transcriptoma completo (RNA-Seq)
    • Análisis de pequeños ARNs (miRNAs)  
  • Epigenética:
    • Análisis de metilación.
    • Estudio de las secuencias de ADN con interacción a proteínas (ChIP-Seq)
    • Estudio de las secuencias de ARN con interacción a proteínas (CLIP-Seq)  
  • Ver listado completo
 
4) Secuenciación capilar y análisis de fragmentos de ADN.

  • Secuenciación de productos de PCR, plásmidos y cósmidos.
  • Caracterización por tamaño de productos de PCR (estudio de microsatélites, STRs y minisatéiltes).
  • Edición y lectura de las secuencias y fragmentos.
  • Ver recomendaciones
  • Ver listado completo
5) PCR cuantitativa a tiempo real.

  • Diseño de primers y sondas óptimos para ensayos de PCR cuantitativa.
    • Diseño de primers y sondas óptimos para ensayos de PCR cuantitativa
    • Desarrollo de PCR cuantitativa a tiempo real.
    • Análisis de datos
  • Determinación del número de copias de regiones repetitivas.
  • Cuantificación absoluta.
  • Ver listado completo

Rt-PCR:

  • Selección de genes candidatos: el investigador podrá tanto indicar qué genes le interesa analizar como solicitar al servicio la selección de genes existente en las bases de datos en función de alguna categoría, como función biológica, localización celular, posición cromosómica, etc.
  • Diseño de primers: atendiendo a si se quiere amplificar ADNc, ADN genómico, etc
  • Análisis de expresión: determinación de niveles de expresión de transcritos mediante real time RT-PCR.
  • Variaciones de splicing: selección de exones anotados, diseño de primers, RT-PCR y electroforesis.
  • Genotipado de SNPs para estudios de discriminación alélica: tanto atendiendo a SNPs concretos como a determinados genes o regiones donde será necesario la búsqueda de SNPs y diseño de sondas por parte del servicio de entre los más de 4,5 millones de SNPs caracterizados.
  • Cálculo del número de copias de un gen determinado.
  • Análisis de microRNAs: mediante el uso de primers específicos.

Algunos de los productos ofrecidos por la casa comercial:

Placas TaqMan® (96-384 Arrays). Más de 270 placas prediseñadas, algunas de ellas:

  • Human p53 Signalin
  • Human Telomere Extension by Telomerase
  • Human DNA Methylation And Transcriptional Repression
  • Human Growth Factors
  • Human Developmental Phases of Colorectal Cancer
  • Human Angiogenesis
  • Human Tumor Metastasis
  • Human Colorectal Cancer Metastasis
  • Human TGF β Pathway
  • Human ILK Signaling
  • Human Breast Cancer Regulations
  • Human Pancreatic Adenocarcinoma
  • Human Breast Cancer Regulations By Stathmin1,
  • Human BRCA1 PATHWAY

Placas y productos TaqMan® en placas de 384 (Microfluidic Cards) prediseñandos

Este producto (TaqMan® Custom Array 384-well micro fluidic card) permite realizar hasta 384 ensayo Taqman sin necesidad de robot, analizando desde 1 a 8 muestras.

Algunas de estas placas:

  • Human Angiogenesis Array
  • Human Apoptosis Array
  • Human Endogenous Control Array
  • Human GPCR Array
  • Human Nuclear Receptor Array
  • Human Protein Kinase Array
  • Human and Mouse Alzheimer's Arrays
  • Human and Mouse Immune Array
  • Human and Rat Inflammation Array
  • Human and Rat Phosphodiesterase Array
  • TaqMan® Array MicroRNA Cards
  • TaqMan® Stem Cell Pluripotency Array

Características de estos ensayos y resto de productos consultar en Applied Biosystems by life technologiesTM: Real-time PCR

Secuenciación por electroforesis capilar:

La secuenciación automática de DNA desarrollada por Applied Biosystems utiliza la metodología de Sanger. Una vez realizada la reacción de secuenciación, el producto de la reacción se separa por electroforesis capilar.

Con esta tecnología se puede realizar el estudio de genes con una elevada tasa de mutación mediante el empleo de primers diseñados por el usuario y optimizados, así como el estudio del ADN mitocondrial. Se pueden secuenciar fragmentos pequeños (BigDye 1.1) 75 a 400pb, y medianos (BigDye 3.1) hasta 1000pb.

Secuenciación completa de un gran listado de genes divididos en amplicones (RSA´s). Tecnología VariantSEQr Mediante primers con colas M13.

Identificación de microorganismos mediante secuenciación del 16S ribosomal.

Aplicaciones basadas en el análisis de fragmentos:

  • STR (short tandem repeats): método para genotipado que se basa en el estudio de la repetición de microsatélites.
  • Análisis de pérdida de heterozigosidad (LOH): que consiste en el empleo de microsatélites para detectar la perdida de la copia silvestre de un gen supresor de tumor en muestras de tumor.
  • Secuenciación de entre 75-1.050 pares de bases a partir de un fragmento de ADN, mediante una única reacción de secuenciación. Puede elegir entre 2 modalidades diferentes:
  Servicio Básico:
Sólo secuenciación.
Servicio Completo:
Todo lo posible por obtener resultados.
Verificación calidad y concentración NO SI
Ajuste de la concentración NO SI
Reacción de secuenciación y electroforesis SI SI
Visualización, edición y valoración de la calidad de los resultados NO SI
Envío de resultados por correo electrónico SI SI
Repetición gratuita de la secuencia NO SI
Plazo de entrega 3 días laborables 5 días laborables

Características de estos ensayos y resto de productos consultar en Applied Biosystems by life technologiesTM: Real-time PCR

Genotipado de alto rendimiento:

Tecnología Beadarray de Illumina : Comprende un amplio listado de tipos de array, y un gran listado de SNP para incluir en los arrays, incluyendo SNPs diseñados por el investigador.

Sobre este tipo de ensayos es siempre mejor contactar con los responsables para asesorarse en el diseño del proyecto. Nos envía la lista de SNPs que desea analizar y nosotros verificamos que puedan ser procesados con ensayo de Illumina.

>Algunos de los productos ofrecidos por la casa comercial:

  • Arrays diseñados por el investigador:
    • Infinium iSelect HD Custom Genotyping BeadChip:
    • Formato para 24 muestras (3,000 a 68,000 ensayos)
    • Formato para 12 muestras (68,001 a 200,000 ensayos). 
    • Semi-custom Human1M-Duo+ BeadChip (1.2 millones de ensayos)
  • Arrays prediseñados:
    • Human1M-Duo DNA Analysis BeadChip Kits (1.2 millones de ensayos)
    • Más de 10,000 SNPs y sondas para la región del complejo de histocompatibilidad (MHC).
    • Más de 20,000 marcadores en más de 300 genes relacionados con absorción, distribución, metabolismo, y excreción de fármacos.
    • Alrededor de 60,000 posiciones con variabilidad (CNV) y regiones que cubren zonas con CNVs no descritas. Se pueden añadir a estos 60,800 SNPs
  • Otros arrays prediseñados: HumanCytoSNP-12 DNA Analysis BeadChip Kits, Focused Genotyping, Linkage Analysis, Whole-Genome Genotyping and Copy Number Analysis, Gene Regulation and Epigenetic Analysis, Array-Based Methylation Analysis, Gene Expression Analysis, Array-Based Transcriptome Analysis, FFPE Sample Analysis, Whole-Genome Gene Expression Analysis,…
 
Servicio Básico:
Sólo genotipado.
Servicio Completo:
Mayor explotación de resultados.
Ayuda en el diseño del experimento
NO
SI
Verificación calidad y concentración
NO
SI
Ajuste de la concentración
NO
SI
Amplificación Genomico, trat. enzimaticos, marcaje array,…
SI
SI
Envío de resultados
SI
SI
Visualización, edición y valoración de la calidad de los resultados
NO
SI
Análisis Bioestadístico preliminar
NO
SI
Registro y copia de seguridad de los resultados
NO
SI

Secuenciación de nueva generación:

Secuenciación SOLiD: (Este sistema se está preparando y estará disponible en breve).

Los distintos servicios se pondrán a punto según su demanda, por favor póngase usted en contacto con nosotros:

Nuestros servicios iniciales incluirán:

Resecuenciación de exomas completos y resecuenciación dirigida; la resecuenciación completa del exoma, fenotipos de respuesta a drogas o fármacos, o genes determinados involucrados en enfermedades, detección de alteraciones estructurales y mutaciones.

  • Preparación de la muestra para su secuenciación masiva
  • Preparación de librerías
  • Captura de ADN con Nimblegen o Agilent kits…etc
  • Secuenciación SOLID
  • Análisis Bioinformático, en distintos formatos:
    • Básico: obtención de las lecturas individuales y valores de calidad asociados.
    • Completo: visualización e interpretación biológica de resultados . Secuencias consenso, listado de SNPs, indels, inversiones, CNVs. (en función del tipo de librería).
  • Soporte cientifico-técnico para facilitar la interpretación de los resultados